中医专业开办于1993年，是国家中等职业教育改革发展示范学校重点建设专业、山东省中等职业学校品牌专业在建项目、济宁市示范专业。拥有专业教师73人，拥有实验实训设备价值1610万元。学生就业方向主要面向基层医疗卫生和社区卫生服务机构及中医药预防保健、康复、养老等就业市场。近三年毕业生就业率达90%，毕业生就业专业对口率86%。积极开展社会培训，累计培训社会人员1万余人次。此外，积极开展中医药“进农村、进社区、进家庭”活动。向社会开放校园。依托国医馆、学校附院开展社区医疗服务，为区域健康服务做出贡献。2015年9月获批成为“2015年山东省职业院校现代学徒制试点”项目，举办“孔伯华中医传承班”4届，2017 年5 月被山东省教育厅列为“2017 年度山东省中等职业教育品牌专业建设项目”。近三年来，中医专业教师在国家、省、市、县、校级教学和专业业务比赛中获得奖励80余项。